Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cwc22Q8C5N3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cwc22Q8C5N3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cwc22Q8C5N3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms