Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc21aQ8C0S4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc21aQ8C0S4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc21aQ8C0S4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms