Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc169Q8BXX9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc169Q8BXX9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc169Q8BXX9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc169Q8BXX9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc169Q8BXX9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc169Q8BXX9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc169Q8BXX9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc169Q8BXX9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc169Q8BXX9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc169Q8BXX9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc169Q8BXX9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc169Q8BXX9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc169Q8BXX9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms