Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW49

Ttc12, Tetratricopeptide repeat protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc12Q8BW49 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc12Q8BW49 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc12Q8BW49 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc12Q8BW49 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc12Q8BW49 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc12Q8BW49 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc12Q8BW49 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc12Q8BW49 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc12Q8BW49 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc12Q8BW49 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc12Q8BW49 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc12Q8BW49 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc12Q8BW49 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc12Q8BW49 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc12Q8BW49 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc12Q8BW49 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc12Q8BW49 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ttc12Q8BW49 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc12Q8BW49 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc12Q8BW49 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc12Q8BW49 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc12Q8BW49 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc12Q8BW49 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc12Q8BW49 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc12Q8BW49 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc12Q8BW49 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc12Q8BW49 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc12Q8BW49 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc12Q8BW49 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc12Q8BW49 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc12Q8BW49 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms