Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmem87bQ8BKU8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem87bQ8BKU8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms