Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
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Pknox2Q8BG99 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pknox2Q8BG99 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pknox2Q8BG99 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pknox2Q8BG99 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pknox2Q8BG99 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Pknox2Q8BG99 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pknox2Q8BG99 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Pknox2Q8BG99 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Pknox2Q8BG99 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Pknox2Q8BG99 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Pknox2Q8BG99 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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