Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms