Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc1Q80VQ1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc1Q80VQ1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc1Q80VQ1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc1Q80VQ1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc1Q80VQ1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc1Q80VQ1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc1Q80VQ1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc1Q80VQ1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc1Q80VQ1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc1Q80VQ1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc1Q80VQ1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc1Q80VQ1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc1Q80VQ1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc1Q80VQ1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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