Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sestd1Q80UK0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sestd1Q80UK0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sestd1Q80UK0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sestd1Q80UK0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sestd1Q80UK0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sestd1Q80UK0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms