Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms