Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPV2

Dzip3, E3 ubiquitin-protein ligase DZIP3, mousemouse

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dzip3Q7TPV2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dzip3Q7TPV2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dzip3Q7TPV2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms