Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stk40Q7TNL3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stk40Q7TNL3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stk40Q7TNL3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stk40Q7TNL3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stk40Q7TNL3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stk40Q7TNL3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stk40Q7TNL3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stk40Q7TNL3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stk40Q7TNL3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stk40Q7TNL3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stk40Q7TNL3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stk40Q7TNL3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stk40Q7TNL3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stk40Q7TNL3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stk40Q7TNL3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stk40Q7TNL3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stk40Q7TNL3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stk40Q7TNL3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stk40Q7TNL3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stk40Q7TNL3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stk40Q7TNL3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stk40Q7TNL3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stk40Q7TNL3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Stk40Q7TNL3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stk40Q7TNL3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stk40Q7TNL3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stk40Q7TNL3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stk40Q7TNL3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stk40Q7TNL3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stk40Q7TNL3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stk40Q7TNL3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stk40Q7TNL3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stk40Q7TNL3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stk40Q7TNL3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms