Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp397Q7TNK4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms