Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms