Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sys1Q78S06 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms