Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rpl35Q6ZWV7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl35Q6ZWV7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms