Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf653Q6YND2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf653Q6YND2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf653Q6YND2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf653Q6YND2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf653Q6YND2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf653Q6YND2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf653Q6YND2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf653Q6YND2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf653Q6YND2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf653Q6YND2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf653Q6YND2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf653Q6YND2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf653Q6YND2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf653Q6YND2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Znf653Q6YND2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Znf653Q6YND2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf653Q6YND2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf653Q6YND2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms