Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc44a1Q6X893 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc44a1Q6X893 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms