Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcl3Q6W5C0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcl3Q6W5C0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms