Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Timd4Q6U7R4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timd4Q6U7R4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms