Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt9Q6RHW0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt9Q6RHW0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt9Q6RHW0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt9Q6RHW0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt9Q6RHW0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt9Q6RHW0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt9Q6RHW0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt9Q6RHW0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt9Q6RHW0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt9Q6RHW0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms