Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc85bQ6PDY0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms