Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vstm2lQ6PDS0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm2lQ6PDS0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms