Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCY5

Gm2163, 4933409K07Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2163Q6PCY5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm2163Q6PCY5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm2163Q6PCY5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm2163Q6PCY5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2163Q6PCY5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2163Q6PCY5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2163Q6PCY5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2163Q6PCY5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2163Q6PCY5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2163Q6PCY5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2163Q6PCY5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2163Q6PCY5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2163Q6PCY5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2163Q6PCY5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2163Q6PCY5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2163Q6PCY5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2163Q6PCY5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2163Q6PCY5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2163Q6PCY5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2163Q6PCY5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2163Q6PCY5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2163Q6PCY5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2163Q6PCY5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2163Q6PCY5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2163Q6PCY5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm2163Q6PCY5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Gm2163Q6PCY5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm2163Q6PCY5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm2163Q6PCY5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm2163Q6PCY5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm2163Q6PCY5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm2163Q6PCY5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm2163Q6PCY5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm2163Q6PCY5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm2163Q6PCY5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm2163Q6PCY5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gm2163Q6PCY5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm2163Q6PCY5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm2163Q6PCY5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm2163Q6PCY5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm2163Q6PCY5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gm2163Q6PCY5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm2163Q6PCY5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm2163Q6PCY5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm2163Q6PCY5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm2163Q6PCY5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm2163Q6PCY5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms