Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Soga3Q6NZL0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms