Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SphkapQ6NSW3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SphkapQ6NSW3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms