Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Krt77Q6IFZ6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt77Q6IFZ6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms