Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nop58Q6DFW4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms