Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
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Pkp4Q68FH0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
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Pkp4Q68FH0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Pkp4Q68FH0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Pkp4Q68FH0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Pkp4Q68FH0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Pkp4Q68FH0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Pkp4Q68FH0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Pkp4Q68FH0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp4Q68FH0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp4Q68FH0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Pkp4Q68FH0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp4Q68FH0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Pkp4Q68FH0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp4Q68FH0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp4Q68FH0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp4Q68FH0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp4Q68FH0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp4Q68FH0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp4Q68FH0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp4Q68FH0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp4Q68FH0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp4Q68FH0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp4Q68FH0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp4Q68FH0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp4Q68FH0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp4Q68FH0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp4Q68FH0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkp4Q68FH0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkp4Q68FH0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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