Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifit1Q64282 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifit1Q64282 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifit1Q64282 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifit1Q64282 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifit1Q64282 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifit1Q64282 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifit1Q64282 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifit1Q64282 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifit1Q64282 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifit1Q64282 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifit1Q64282 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifit1Q64282 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifit1Q64282 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifit1Q64282 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifit1Q64282 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifit1Q64282 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifit1Q64282 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifit1Q64282 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifit1Q64282 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifit1Q64282 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifit1Q64282 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ifit1Q64282 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifit1Q64282 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifit1Q64282 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifit1Q64282 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifit1Q64282 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifit1Q64282 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifit1Q64282 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifit1Q64282 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifit1Q64282 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms