Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6eQ64253 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6eQ64253 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms