Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PatjQ63ZW7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PatjQ63ZW7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PatjQ63ZW7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms