Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TrhQ62361 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TrhQ62361 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TrhQ62361 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TrhQ62361 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TrhQ62361 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TrhQ62361 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TrhQ62361 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TrhQ62361 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TrhQ62361 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TrhQ62361 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TrhQ62361 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TrhQ62361 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TrhQ62361 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TrhQ62361 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TrhQ62361 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms