Protein–RNA interactions for Protein: Q61805

Lbp, Lipopolysaccharide-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbpQ61805 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LbpQ61805 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LbpQ61805 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LbpQ61805 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LbpQ61805 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LbpQ61805 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LbpQ61805 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LbpQ61805 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LbpQ61805 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LbpQ61805 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LbpQ61805 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LbpQ61805 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LbpQ61805 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LbpQ61805 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LbpQ61805 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LbpQ61805 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LbpQ61805 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LbpQ61805 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LbpQ61805 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LbpQ61805 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LbpQ61805 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LbpQ61805 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LbpQ61805 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LbpQ61805 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LbpQ61805 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LbpQ61805 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LbpQ61805 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LbpQ61805 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LbpQ61805 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LbpQ61805 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LbpQ61805 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LbpQ61805 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LbpQ61805 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LbpQ61805 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LbpQ61805 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LbpQ61805 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LbpQ61805 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LbpQ61805 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LbpQ61805 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LbpQ61805 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LbpQ61805 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LbpQ61805 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LbpQ61805 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LbpQ61805 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LbpQ61805 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LbpQ61805 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LbpQ61805 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LbpQ61805 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LbpQ61805 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LbpQ61805 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms