Protein–RNA interactions for Protein: Q61550

Rad21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad21Q61550 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rad21Q61550 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rad21Q61550 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rad21Q61550 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rad21Q61550 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rad21Q61550 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rad21Q61550 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Rad21Q61550 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rad21Q61550 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Rad21Q61550 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rad21Q61550 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rad21Q61550 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rad21Q61550 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rad21Q61550 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rad21Q61550 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rad21Q61550 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rad21Q61550 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rad21Q61550 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rad21Q61550 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rad21Q61550 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rad21Q61550 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rad21Q61550 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms