Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smarcd1Q61466 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smarcd1Q61466 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms