Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ift20Q61025 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ift20Q61025 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ift20Q61025 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ift20Q61025 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ift20Q61025 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ift20Q61025 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ift20Q61025 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ift20Q61025 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ift20Q61025 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ift20Q61025 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ift20Q61025 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ift20Q61025 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ift20Q61025 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ift20Q61025 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ift20Q61025 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ift20Q61025 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ift20Q61025 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ift20Q61025 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ift20Q61025 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ift20Q61025 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ift20Q61025 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ift20Q61025 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ift20Q61025 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ift20Q61025 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms