Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxg1Q60987 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms