Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms