Protein–RNA interactions for Protein: Q60931

Vdac3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac3Q60931 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vdac3Q60931 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vdac3Q60931 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms