Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Neurod1Q60867 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Neurod1Q60867 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Neurod1Q60867 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Neurod1Q60867 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Neurod1Q60867 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Neurod1Q60867 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms