Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Atf3Q60765 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atf3Q60765 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atf3Q60765 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms