Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Epha1Q60750 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Epha1Q60750 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms