Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam71bQ5STT6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam71bQ5STT6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam71bQ5STT6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam71bQ5STT6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam71bQ5STT6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam71bQ5STT6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam71bQ5STT6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam71bQ5STT6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam71bQ5STT6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam71bQ5STT6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam71bQ5STT6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam71bQ5STT6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam71bQ5STT6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam71bQ5STT6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam71bQ5STT6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam71bQ5STT6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam71bQ5STT6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam71bQ5STT6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam71bQ5STT6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms