Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQK8

4930512M02Rik, RIKEN cDNA 4930512M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930512M02RikQ5SQK8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930512M02RikQ5SQK8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms