Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps54Q5SPW0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms