Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Scarf1Q5ND28 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scarf1Q5ND28 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms