Protein–RNA interactions for Protein: Q5M956

Kctd1, BTB/POZ domain-containing protein KCTD1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd1Q5M956 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kctd1Q5M956 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms