Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Usp28Q5I043 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp28Q5I043 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms