Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnni3kQ5GIG6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms